Поверхня лімфовузла огорнута капсулою із сполучної тканини. На розрізі органа ближче до капсули розміщена зона коркової речовини, далі – зона мозкової речовини. Лімфатичний вузол містить велику кількість різноманітних імунних клітин – В- і Т-лімфоцитів, макрофагів та інших.
Лімфа, яка надходить від органів та частин тіла, по приносній лімфатичній судині потрапляє у лімфовузол. Далі вона повільно просочується через внутрішні щілини – лімфатичні синуси. Порожнина синуса перегороджена тривимірною мережею. Завдяки такій будові синусів забезпечується повільний рух рідини і відбувається очищення лімфи від чужорідних агентів, збагачення антитілами, запуск реакцій імунної відповіді. Через виносну лімфатичну судину очищена і збагачена імуноглобулінами лімфа витікає з вузла. Фактично лімфовузол є бар’єром, який запобігає поширенню інфекції, токсичних речовин та дефектних клітин.